More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4031 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0722  ATPase  51.14 
 
 		 834 aa  867    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  47.6 
 
 		 828 aa  772    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  51.2 
 
 		 831 aa  819    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  100 
 
 		 833 aa  1704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  27.34 
 
 		 904 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  27.16 
 
 		 904 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.51 
 
 		 904 aa  310  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  25.96 
 
 		 903 aa  291  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.25 
 
 		 906 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  25.53 
 
 		 1043 aa  253  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  24.68 
 
 		 943 aa  212  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  24.42 
 
 		 882 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  23.93 
 
 		 962 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 1017 aa  196  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 		 887 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.44 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  29.43 
 
 		 588 aa  165  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  26.15 
 
 		 592 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  27.25 
 
 		 635 aa  163  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  26.54 
 
 		 602 aa  161  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  25.18 
 
 		 572 aa  160  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  27.31 
 
 		 617 aa  160  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.42 
 
 		 566 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  27.06 
 
 		 617 aa  158  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.44 
 
 		 580 aa  157  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.89 
 
 		 600 aa  157  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  25.97 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  27.12 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  26.98 
 
 		 870 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.65 
 
 		 598 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  28.02 
 
 		 634 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  26.61 
 
 		 637 aa  155  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  23.37 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  25.71 
 
 		 597 aa  155  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.82 
 
 		 592 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  25.48 
 
 		 597 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  27 
 
 		 611 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  25.45 
 
 		 663 aa  154  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  26.03 
 
 		 611 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.46 
 
 		 597 aa  154  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.64 
 
 		 622 aa  153  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  25.35 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  25.8 
 
 		 607 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  26.59 
 
 		 602 aa  152  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  25.46 
 
 		 572 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.51 
 
 		 671 aa  152  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.16 
 
 		 613 aa  151  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  24.82 
 
 		 784 aa  150  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  26.77 
 
 		 594 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  25.06 
 
 		 603 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.7 
 
 		 596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  26.88 
 
 		 663 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  26.1 
 
 		 607 aa  149  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  26.23 
 
 		 611 aa  149  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  25.96 
 
 		 764 aa  149  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  25.06 
 
 		 572 aa  148  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  25.96 
 
 		 613 aa  147  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  25.34 
 
 		 1321 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  23.96 
 
 		 625 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  26.17 
 
 		 773 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  27.31 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  27.72 
 
 		 614 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  23.33 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.33 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  25.36 
 
 		 598 aa  146  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  25 
 
 		 620 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.15 
 
 		 575 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.74 
 
 		 598 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  24.44 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  26.79 
 
 		 606 aa  145  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  25.71 
 
 		 600 aa  145  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.74 
 
 		 598 aa  145  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  26.48 
 
 		 616 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.33 
 
 		 571 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.33 
 
 		 571 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.33 
 
 		 571 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.91 
 
 		 586 aa  144  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.33 
 
 		 571 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.33 
 
 		 571 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.17 
 
 		 618 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  25.64 
 
 		 610 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.33 
 
 		 571 aa  144  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.94 
 
 		 637 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  25.73 
 
 		 612 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.53 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  26.11 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  26.85 
 
 		 592 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  24.88 
 
 		 760 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  21.95 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  25.98 
 
 		 652 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  26.11 
 
 		 814 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  25.13 
 
 		 606 aa  143  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.08 
 
 		 571 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  23.86 
 
 		 635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  27.11 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  26.34 
 
 		 784 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  25.4 
 
 		 610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  26.28 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  28.14 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  24.83 
 
 		 594 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>