More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2324 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  100 
 
 		 327 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  87.46 
 
 		 327 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  87.46 
 
 		 327 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.93 
 
 		 327 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  88 
 
 		 327 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.81 
 
 		 327 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  84.8 
 
 		 329 aa  551  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  84.62 
 
 		 327 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.85 
 
 		 326 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.95 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.59 
 
 		 343 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.94 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  83.6 
 
 		 322 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.18 
 
 		 321 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  83.99 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.65 
 
 		 328 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  80.18 
 
 		 334 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  82.7 
 
 		 322 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  82.54 
 
 		 334 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.06 
 
 		 328 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  79.75 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  80.25 
 
 		 326 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.21 
 
 		 328 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.3 
 
 		 322 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  79.43 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  81.79 
 
 		 305 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  80.85 
 
 		 329 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.04 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  79.08 
 
 		 327 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  75.69 
 
 		 327 aa  461  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  75.79 
 
 		 327 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  68.06 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  71.1 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.87 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.56 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.51 
 
 		 353 aa  346  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  60.88 
 
 		 348 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60 
 
 		 350 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  59.62 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  60.84 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  62.08 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.62 
 
 		 344 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.03 
 
 		 351 aa  341  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  60.93 
 
 		 356 aa  341  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  59.55 
 
 		 343 aa  341  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  60.51 
 
 		 349 aa  341  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.52 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.87 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.84 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.46 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  59.55 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  62.89 
 
 		 344 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.63 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.11 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.61 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  48.38 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  50.33 
 
 		 329 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  48.52 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  48.68 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  48.48 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.36 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.53 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  47.23 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  44.44 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.99 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.05 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  47.59 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.36 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  45.75 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  45.7 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  45.75 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  39.41 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.56 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  44.26 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  39.38 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  41.38 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.37 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  36.07 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.18 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.33 
 
 		 464 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.25 
 
 		 441 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  37.23 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 491 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 452 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  39.61 
 
 		 438 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 440 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  37.72 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  35.88 
 
 		 442 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.87 
 
 		 472 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  36.03 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  38.18 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  37.66 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5630  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00466879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.18 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>