More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1895 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 356 aa  695    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  97.75 
 
 		 356 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  89.61 
 
 		 344 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  88.89 
 
 		 353 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  93.95 
 
 		 354 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  89.04 
 
 		 344 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  91.85 
 
 		 350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  92.88 
 
 		 358 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  88.2 
 
 		 356 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  88.48 
 
 		 355 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  84.87 
 
 		 349 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.8 
 
 		 345 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  87.08 
 
 		 344 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.47 
 
 		 351 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.55 
 
 		 350 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  87.88 
 
 		 348 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  77.81 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  60.56 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  62.16 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.26 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.17 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.05 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.88 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.95 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  61.39 
 
 		 322 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  59.13 
 
 		 327 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  60.32 
 
 		 327 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.65 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.77 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  58.97 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.77 
 
 		 342 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.71 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.59 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.59 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  60 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  59.94 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  59.81 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.61 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  60.77 
 
 		 332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.2 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.31 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.62 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  58.12 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.55 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  59.87 
 
 		 334 aa  351  8.999999999999999e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  59.29 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.54 
 
 		 328 aa  349  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.2 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  59.75 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  61.72 
 
 		 327 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  59.67 
 
 		 327 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.86 
 
 		 323 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.39 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.97 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.84 
 
 		 318 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  49.34 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  50.16 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  47.06 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  47.76 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  47.52 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  46.23 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  46.23 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  43.71 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 319 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  46.86 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  45.08 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.25 
 
 		 329 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  42.43 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.04 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.06 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  43.43 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.45 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.19 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  42.67 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.32 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  35.08 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  32.48 
 
 		 451 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.02 
 
 		 572 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  35.2 
 
 		 449 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.71 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.73 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 450 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  35.81 
 
 		 491 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  34.38 
 
 		 594 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  35.64 
 
 		 432 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.1 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  32.65 
 
 		 589 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 472 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.26 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.77 
 
 		 460 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.74 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  37.29 
 
 		 444 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 444 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>