More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9661 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  100 
 
 		 320 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  67.21 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  71.05 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  68.42 
 
 		 323 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  68.09 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  64.82 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  51.32 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  51.32 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  48.37 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  50.34 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  49.51 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.79 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.06 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.39 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.06 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  48.06 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.34 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  51.12 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.86 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.23 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  47.83 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  46.5 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.67 
 
 		 326 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.94 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.94 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  50.96 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  50 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.85 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.02 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.29 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  46.73 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.04 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  46.98 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  50 
 
 		 355 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.66 
 
 		 350 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.68 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.03 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  48.51 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.51 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  47.13 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.89 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.16 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.25 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  47.19 
 
 		 334 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  48.72 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  45.4 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.79 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.92 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.36 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.34 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.69 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  47.6 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.92 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  46.69 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.76 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.51 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.08 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  48.08 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.6 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.41 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  46.69 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  47.76 
 
 		 358 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  45.9 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  45.85 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  44.06 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  47.12 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  46.96 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.47 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.52 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  46.93 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.23 
 
 		 325 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 319 aa  215  9e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  40.75 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.36 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.39 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.63 
 
 		 473 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.81 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 444 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  34.37 
 
 		 466 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 455 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.81 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 467 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.09 
 
 		 594 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.81 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  36 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  34.89 
 
 		 478 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 513 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  32.68 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 416 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.16 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  34.81 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 487 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  35.22 
 
 		 563 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>