More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2350 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 
351 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  93 
 
 
349 aa  607  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  95.76 
 
 
348 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  94.89 
 
 
356 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  89.77 
 
 
350 aa  584  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  93.09 
 
 
355 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  88.59 
 
 
356 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  88.29 
 
 
356 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.55 
 
 
344 aa  551  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.39 
 
 
344 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  86.61 
 
 
354 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.68 
 
 
353 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  85.76 
 
 
358 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.14 
 
 
350 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  84.68 
 
 
344 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.45 
 
 
345 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  84.01 
 
 
343 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.5 
 
 
325 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.94 
 
 
321 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  63.12 
 
 
322 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.79 
 
 
327 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.13 
 
 
327 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  59.49 
 
 
329 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  61.49 
 
 
326 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  58.02 
 
 
327 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  59.55 
 
 
327 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.37 
 
 
326 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.31 
 
 
332 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  60.51 
 
 
326 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.27 
 
 
333 aa  358  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.36 
 
 
328 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.54 
 
 
334 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  62.03 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.88 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  61.51 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.88 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.36 
 
 
343 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.68 
 
 
342 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  60.74 
 
 
322 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  59.74 
 
 
334 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  59.55 
 
 
334 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.34 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  58.05 
 
 
305 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.02 
 
 
328 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.1 
 
 
325 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  58.97 
 
 
332 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.39 
 
 
328 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.15 
 
 
329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  57.91 
 
 
327 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  60.13 
 
 
327 aa  329  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.8 
 
 
325 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  55.52 
 
 
327 aa  319  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.05 
 
 
320 aa  309  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.81 
 
 
323 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50 
 
 
318 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  49.34 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  47.88 
 
 
325 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  46.35 
 
 
323 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  48.89 
 
 
320 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  46.35 
 
 
323 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  47 
 
 
321 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  43.13 
 
 
366 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  46.41 
 
 
320 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  46.73 
 
 
329 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  46.41 
 
 
320 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  42.81 
 
 
319 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  40 
 
 
319 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.52 
 
 
310 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.32 
 
 
329 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.93 
 
 
309 aa  235  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  42.11 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.72 
 
 
322 aa  225  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  43.1 
 
 
321 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.01 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  44.37 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.09 
 
 
325 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.95 
 
 
346 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.31 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  34.08 
 
 
451 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  34.65 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.05 
 
 
594 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  32.06 
 
 
589 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  35.67 
 
 
450 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
449 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32 
 
 
569 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.66 
 
 
464 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.82 
 
 
472 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.01 
 
 
474 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.57 
 
 
468 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.78 
 
 
444 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.22 
 
 
473 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.94 
 
 
449 aa  159  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  30.89 
 
 
572 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.84 
 
 
455 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  36.3 
 
 
432 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  35.49 
 
 
349 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
463 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  34.44 
 
 
479 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  36.45 
 
 
491 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
465 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>