More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1555 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  100 
 
 		 105 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  61.9 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  60 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  60 
 
 		 105 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  58.1 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  59 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  56 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  54.29 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  46.6 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  46.6 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  46.6 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  48.54 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  45.63 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  46.6 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  45.63 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  45.63 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.57 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.19 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  47.57 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.66 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 		 110 aa  85.5  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  40.68 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1640  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.68 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0931599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  44.23 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  44.44 
 
 		 555 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  48.08 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  45.87 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  35.83 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  38.68 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  48.08 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.67 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  41.51 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.28 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  43.27 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>