More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1628 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  87.29 
 
 		 118 aa  206  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.12 
 
 		 118 aa  186  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  77.12 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  77.12 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  77.97 
 
 		 117 aa  176  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  79.09 
 
 		 117 aa  173  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  69.16 
 
 		 108 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  55.26 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  59.81 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  62.86 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  61.54 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  55.77 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  52.94 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  48.08 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  46.6 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  41.96 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  42 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  38.79 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  37.96 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  37.96 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  37.96 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  35.54 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  39.66 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  39.66 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  38.68 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  38.89 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  39.66 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>