More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1433 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
106 aa  209  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  58.65 
 
 
105 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  56 
 
 
105 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  55 
 
 
105 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  56 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  56 
 
 
105 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 
105 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  55.05 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 
116 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.21 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.7 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  48.04 
 
 
105 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 
118 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  45.63 
 
 
105 aa  105  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 
118 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  56 
 
 
105 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
108 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.23 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  38.6 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  39.83 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  45.87 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  46.73 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  44.95 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  44.95 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0525  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.291084  normal  0.274435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1455  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  41.12 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  43.12 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  43.12 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.57 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  37.29 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.68 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.68 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  39.62 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.68 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  41.28 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.68 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>