More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_942 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  98.21 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  92.86 
 
 		 112 aa  213  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  130  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  54.46 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  52.68 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  56.25 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  58.04 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  119  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  119  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  119  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  119  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>