More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2156 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  218  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  218  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  92.86 
 
 		 112 aa  203  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  196  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  190  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  184  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 133 aa  179  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.89 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  76.79 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2112  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  175  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  74.11 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  74.11 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 117 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 117 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  73.21 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  70.54 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.36 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>