More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2274 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  66.07 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  64.29 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 114 aa  150  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  62.5 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>