More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2852 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  222  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  186  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  78.57 
 
 
112 aa  180  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  176  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 
112 aa  173  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  173  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 
112 aa  170  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  72.32 
 
 
112 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  169  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  169  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  168  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  168  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  167  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  68.75 
 
 
112 aa  166  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 
112 aa  166  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  166  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  164  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 
112 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  70.54 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>