More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0715 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  183  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  78.57 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 114 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  74.11 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.21 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  72.32 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  72.32 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  170  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  78.3 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.83 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.83 
 
 		 112 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.83 
 
 		 112 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>