More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1021 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  100 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  68.75 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  71.43 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  66.96 
 
 		 114 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  63.39 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>