More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03014 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03014  GlnB  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  187  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  78.57 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  78.57 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  78.57 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 114 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  77.68 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  76.79 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  76.79 
 
 		 114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  76.79 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  175  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  72.32 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  75 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>