More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0552 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  220  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  66.07 
 
 		 114 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  66.07 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 117 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 117 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  60.71 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>