More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0132 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  215  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  186  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  179  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  169  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
117 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
117 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  168  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  164  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 
112 aa  164  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  163  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 
112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  66.07 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  160  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 
112 aa  159  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  158  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  158  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  158  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 
112 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  66.07 
 
 
114 aa  157  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>