More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0148 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  201  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  187  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.36 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 117 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 117 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  71.43 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  78.57 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  71.43 
 
 		 114 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  75.89 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2229  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>