More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2577 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  66.1 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  56.19 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  58.1 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 		 112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  53.64 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  53.64 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  50.91 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.29 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  52.38 
 
 		 555 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.78 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  54.55 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  51.82 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  54.81 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.93 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.93 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.93 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  49.52 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  52.78 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  49.52 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.38 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.85 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50.48 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  49.52 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.82 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  50.48 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  50.48 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.15 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  50.48 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>