More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1063 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  221  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  66.06 
 
 
112 aa  146  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  64.81 
 
 
112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
111 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
113 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  66.04 
 
 
112 aa  140  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  137  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  65.14 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  65.14 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  65.14 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  63.89 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  55.36 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
117 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
117 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 
112 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  62.04 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  62.04 
 
 
112 aa  133  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  57.8 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  57.8 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  56.88 
 
 
112 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  131  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  58.72 
 
 
112 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.72 
 
 
112 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  55.96 
 
 
112 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  61.47 
 
 
112 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  56.88 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.26 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  58.93 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  62.04 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  52.68 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  59.26 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  61.11 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  58.49 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.88 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  55.05 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  55.96 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  55.96 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  59.26 
 
 
112 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  56.88 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  56.88 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>