More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0556 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
113 aa  156  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  150  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
113 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  143  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
111 aa  143  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  141  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
114 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  57.14 
 
 
112 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  54.46 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  58.04 
 
 
112 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  131  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  130  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 
112 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  55.36 
 
 
112 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  56.25 
 
 
112 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  130  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  56.25 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>