More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1020 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  225  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  156  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  63.72 
 
 
113 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  153  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  147  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  59.82 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  59.81 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  131  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  57.14 
 
 
112 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  55.45 
 
 
117 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  55.45 
 
 
117 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  57.8 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  57.8 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.88 
 
 
112 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2229  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  55.96 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  124  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  54.46 
 
 
112 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  53.57 
 
 
112 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  54.46 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  57.8 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  55.05 
 
 
112 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 
116 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 
116 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  55.36 
 
 
114 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>