More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1730 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  220  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  220  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  93.75 
 
 		 112 aa  211  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  55.36 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  57.14 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  55.36 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2229  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>