More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0993 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  187  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  75.93 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  75.93 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16421  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  76.85 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1556  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.995978  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16531  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0329531  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16651  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  75.93 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04671  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  73.15 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  61.61 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  64.81 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  61.61 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  58.04 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  59.82 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  136  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  55.36 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  64.15 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  57.94 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  60.71 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>