More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0470 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  215  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  93.75 
 
 
112 aa  201  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16651  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1556  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.995978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  168  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16531  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0329531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16421  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04671  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 
112 aa  150  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  62.5 
 
 
112 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  143  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  143  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
114 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  60.71 
 
 
112 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 
112 aa  141  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.09 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  60.71 
 
 
114 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  140  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 
112 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  140  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 
112 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  139  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  139  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  56.25 
 
 
112 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  137  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  138  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>