More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1304 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  80.36 
 
 		 116 aa  183  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 116 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 116 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  76.79 
 
 		 112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.68 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3050  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0076  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0461291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 114 aa  168  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  70.54 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  68.75 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  72.32 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  71.43 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>