More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3024 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  59.82 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>