More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1181 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 136 aa  183  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0808  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0779  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3159  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  172  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 114 aa  169  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  70.54 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 121 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.97 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.87 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  70.54 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.21 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>