More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1489 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
113 aa  224  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  69.64 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  143  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  140  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 
112 aa  140  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  58.04 
 
 
112 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 
112 aa  136  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  58.04 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  58.04 
 
 
112 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0726  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  133  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  56.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  56.25 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>