More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2479 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  66.07 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  68.75 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2112  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 114 aa  150  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>