More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3047 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  60.71 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  59.82 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>