More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1888 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  225  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
113 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  144  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
111 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  130  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  129  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  129  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  61.11 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  54.46 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  57.14 
 
 
112 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
114 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  128  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  61.11 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  57.14 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  52.68 
 
 
112 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  56.25 
 
 
112 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  53.57 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  51.79 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  52.68 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  59.26 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  52.68 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  52.68 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0522  nitrogen regulatory protein P-II 2  53.57 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  52.68 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  52.68 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0512  nitrogen regulatory protein P-II 2  53.57 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  52.68 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>