More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0141 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 113 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 113 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 		 112 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  53.57 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4056  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>