More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0935 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  214  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 		 112 aa  186  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  66.96 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 114 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  64.29 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  66.96 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  64.29 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>