More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2861 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  227  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  58.04 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  58.18 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  58.18 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  58.04 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>