More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1017 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  220  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  63.72 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 111 aa  146  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 117 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 117 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  133  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  56.25 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  53.57 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  52.68 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>