More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1065 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  220  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 111 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  62.5 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  62.39 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  56.88 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  54.46 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.21 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  62.39 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  59.63 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  61.11 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  59.82 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>