More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4574 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  214  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  68.75 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  67.86 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>