More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4445 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  100 
 
 
112 aa  222  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 
113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  64.29 
 
 
112 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  147  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 
112 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  59.82 
 
 
116 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  62.5 
 
 
112 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 
112 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  58.04 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 
112 aa  138  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.93 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  58.04 
 
 
112 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  137  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 
112 aa  136  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3854  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.069365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  57.14 
 
 
112 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
114 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  61.68 
 
 
112 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  60.75 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>