More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3854 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3854  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.069365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 114 aa  153  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  64.81 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  67.92 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  62.5 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  62.5 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  64.29 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  64.86 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>