More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0187 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  64.94 
 
 
562 aa  657    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  100 
 
 
555 aa  1111    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  68.39 
 
 
441 aa  543  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  67.79 
 
 
445 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  47.61 
 
 
471 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  34.36 
 
 
584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  41.59 
 
 
446 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.58 
 
 
408 aa  254  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  40.36 
 
 
408 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  39.59 
 
 
408 aa  251  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  39.49 
 
 
468 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  40.1 
 
 
408 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  40.44 
 
 
461 aa  247  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  39.18 
 
 
411 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  38.04 
 
 
444 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  40.37 
 
 
478 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  39.04 
 
 
411 aa  243  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  40.14 
 
 
478 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.38 
 
 
515 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.38 
 
 
515 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  37.95 
 
 
441 aa  240  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  39.14 
 
 
411 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.18 
 
 
411 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  39.14 
 
 
411 aa  237  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  34.5 
 
 
511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  38.86 
 
 
433 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  37.92 
 
 
461 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  35.83 
 
 
525 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  34.76 
 
 
469 aa  233  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  38.15 
 
 
497 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  36.45 
 
 
460 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  38.48 
 
 
490 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  39.55 
 
 
403 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  87.6 
 
 
125 aa  228  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  36.87 
 
 
445 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  35.92 
 
 
416 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  39.09 
 
 
489 aa  225  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  38.5 
 
 
408 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  36.25 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  40.05 
 
 
471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  36.93 
 
 
416 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  39.56 
 
 
476 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  33.64 
 
 
441 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  37.83 
 
 
496 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  37.83 
 
 
496 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  38.48 
 
 
437 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  37.74 
 
 
482 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  34.74 
 
 
416 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  34.86 
 
 
408 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  35.1 
 
 
416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  35.1 
 
 
416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  39.28 
 
 
442 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  34.3 
 
 
416 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  34.49 
 
 
506 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  37.77 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  38.61 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  34.38 
 
 
416 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  38.61 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  34.86 
 
 
416 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  38.52 
 
 
487 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  34.86 
 
 
416 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  37.05 
 
 
435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  37.05 
 
 
435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  34.86 
 
 
416 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  38.61 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  37.96 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  40 
 
 
435 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  36.53 
 
 
409 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  34.86 
 
 
416 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.73 
 
 
449 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  37.68 
 
 
442 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.43 
 
 
483 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  34.35 
 
 
518 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  35.19 
 
 
441 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  35.63 
 
 
422 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  36.12 
 
 
507 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  35.89 
 
 
506 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  35.5 
 
 
462 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  35.47 
 
 
446 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  33.11 
 
 
488 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  33.33 
 
 
644 aa  204  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  34.26 
 
 
509 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  34.89 
 
 
409 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  36.71 
 
 
440 aa  203  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  33.73 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  35.63 
 
 
384 aa  200  7e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  34.5 
 
 
507 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  33.41 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  36.56 
 
 
416 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  35.84 
 
 
381 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  36.32 
 
 
420 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  33.87 
 
 
426 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  33.26 
 
 
414 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  36.36 
 
 
449 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  32.45 
 
 
512 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  35.44 
 
 
488 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  82.3 
 
 
116 aa  195  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  34.5 
 
 
416 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  32.94 
 
 
433 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.64 
 
 
421 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>