More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0882 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  78.1 
 
 		 411 aa  645    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  94.4 
 
 		 411 aa  772    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  100 
 
 		 411 aa  813    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  77.86 
 
 		 411 aa  647    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  79.32 
 
 		 411 aa  653    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  67.8 
 
 		 408 aa  584  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  70.73 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  70.24 
 
 		 408 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  70.49 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  69.4 
 
 		 403 aa  541  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  41.63 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  41.48 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  40.68 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  40.73 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  40.1 
 
 		 406 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  39.85 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  38.81 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  38.89 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  38.5 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  38.73 
 
 		 400 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  37.98 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  39.32 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  39.11 
 
 		 400 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  39.04 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  38.82 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  40.48 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  40.73 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  38.11 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  40.1 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  39.18 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  38.26 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  38.39 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  38.2 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  38.69 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  37.86 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  37.25 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  38.73 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  37.47 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  37.75 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  36.76 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  39.62 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  38.44 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  38.93 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  37.72 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  37.72 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  38.67 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  39.95 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  38.11 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  39.21 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  37.78 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  38.63 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  37.71 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  37.8 
 
 		 444 aa  229  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  38.2 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  37.71 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  39.95 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  37.47 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  38.13 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  36.12 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.7 
 
 		 1262 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  38.13 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  39.41 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  38.21 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  39.22 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  39.42 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  38.24 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  37.99 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  39.41 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  38.63 
 
 		 445 aa  222  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  37.67 
 
 		 478 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  37.14 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  40.39 
 
 		 449 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  37.5 
 
 		 469 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  36.8 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  38.44 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  37.56 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.49 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  38.92 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  35.96 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  35.83 
 
 		 562 aa  212  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  36.12 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  36.62 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.53 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  37.32 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  38.9 
 
 		 483 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  37.14 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  37.14 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  35.86 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  35.58 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  35.4 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  34.72 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  34.72 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  38.32 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  36.43 
 
 		 482 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.47 
 
 		 1018 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.3 
 
 		 1016 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  36.3 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  34.82 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  37.53 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  35.14 
 
 		 437 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>