More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0880 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  97.32 
 
 		 411 aa  784    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  77.86 
 
 		 411 aa  659    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  96.11 
 
 		 411 aa  775    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  100 
 
 		 411 aa  814    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  78.83 
 
 		 411 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  68.05 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  69.02 
 
 		 408 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  68.54 
 
 		 408 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  68.78 
 
 		 408 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  65.75 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  42.58 
 
 		 406 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  42.55 
 
 		 406 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  40.43 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  40.44 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  39.95 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  40.34 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  37.78 
 
 		 399 aa  269  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  37.92 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  41.42 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  39.07 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  38.73 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  38.63 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  37.84 
 
 		 400 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  38.89 
 
 		 404 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  38.48 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  37.75 
 
 		 400 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  39.95 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  37.23 
 
 		 405 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  38.14 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  38.52 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  37.47 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  38.24 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  37.59 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  39.14 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  37.25 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  37.25 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  36.25 
 
 		 402 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  36.25 
 
 		 402 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  37.2 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  36.23 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  37.17 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  35.77 
 
 		 402 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  35.7 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  39.35 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  38.96 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  39.35 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  38.08 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  38.08 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  37.84 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  37.75 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  37.84 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  37.99 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  37.35 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  35.29 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  38.82 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  38.59 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  36.23 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  38.11 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  36.08 
 
 		 402 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  35.99 
 
 		 460 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  36.23 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  36.71 
 
 		 402 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  36.23 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  35.19 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  37.33 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  35.83 
 
 		 471 aa  219  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  37.1 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  36.17 
 
 		 469 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  36.08 
 
 		 458 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  37.87 
 
 		 471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  39.16 
 
 		 449 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  38.01 
 
 		 446 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  37.08 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.1 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  38.87 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  35.97 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.28 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  35.46 
 
 		 476 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  36.34 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  34.49 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  35.96 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.68 
 
 		 1262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  34.77 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  36.19 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  34.09 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  35.89 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  35.89 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  33.81 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  36.45 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  34.25 
 
 		 506 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 1209 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  35.39 
 
 		 496 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  35.39 
 
 		 496 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  35.89 
 
 		 408 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.43 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  33.58 
 
 		 497 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  34.61 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  35.97 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.05 
 
 		 1016 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  32.21 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>