More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0186 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  87.6 
 
 		 555 aa  228  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  71.31 
 
 		 562 aa  190  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  76.11 
 
 		 116 aa  184  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  76.99 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  70.94 
 
 		 121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  47.32 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  55.05 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  46.28 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  55.05 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.32 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.32 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  52.68 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  49.52 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>