More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1063 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  217  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  93.75 
 
 
112 aa  207  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  92.86 
 
 
112 aa  206  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  174  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
113 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  157  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  157  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  147  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  137  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  125  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  123  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  59.82 
 
 
112 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  120  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  120  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  119  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
113 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  58.25 
 
 
107 aa  117  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  54.46 
 
 
112 aa  116  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 
121 aa  114  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
113 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 
109 aa  114  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>