More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0883 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  91.07 
 
 		 112 aa  200  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  55.34 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  54.46 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  56.48 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  51.79 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.83 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  50.89 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>