More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1611 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  93.75 
 
 		 112 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  93.75 
 
 		 112 aa  207  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  176  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 113 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  55.36 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  59.22 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  54.13 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  55.14 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  55.36 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  54.13 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  54.46 
 
 		 114 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>