More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1359 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  95.58 
 
 		 124 aa  215  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  80.53 
 
 		 116 aa  185  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  76.72 
 
 		 555 aa  184  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  71.79 
 
 		 562 aa  173  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  70.25 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  55.14 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  47.32 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  49.11 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>