More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1361 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
121 aa  243  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  70.94 
 
 
125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  71.55 
 
 
555 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  70.25 
 
 
121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  73.45 
 
 
116 aa  170  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  73.45 
 
 
124 aa  167  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  64.91 
 
 
562 aa  154  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  48.21 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 
112 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  48.21 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
114 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
112 aa  107  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 
112 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.43 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.43 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 
112 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  50.46 
 
 
117 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  50.46 
 
 
112 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  50.46 
 
 
117 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  104  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 
112 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 
112 aa  103  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.64 
 
 
112 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 
112 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 
112 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
112 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
112 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 
112 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  47.32 
 
 
112 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>