More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1081 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  152  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  144  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  143  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  58.93 
 
 
112 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  120  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  120  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  120  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  53.57 
 
 
112 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
124 aa  116  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  116  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  56.86 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 
112 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>